Namun menurut kepercayaan orang Yahudi, dahulu tempat yang sekarang menjadi Masjid Al-Aqsa dipercaya sebagai tempat berdirinya Bait Suci.
Masjid Al-Aqsa juga memiliki kaitan erat dengan para nabi dan tokoh Bani Israel yang dipercaya dalam ketiga agama sekaligus.